En raison de sa dépendance à l'égard des récifs d'Acropora, O. longirostris est susceptible de voir sa population décliner en raison de la perte de son habitat dans certaines parties de son aire de répartition. En 2008, 15 % des récifs coralliens du monde étaient considérés comme étant sous la menace imminente d'une « perte effective » (avec 90 % des coraux perdus et peu susceptibles de se rétablir rapidement), les régions d'Afrique de l'Est, d'Asie du Sud et d'Asie du Sud-Est étant les plus menacées. Sur les 704 espèces de coraux zooxanthellés construisant des récifs qui ont été évaluées à l'aide des critères de la liste rouge de l'Union internationale pour la conservation de la nature, 32,8 % appartiennent à des catégories présentant un risque élevé d'extinction. Sur les 167 espèces d'Acropora présentes dans l'Indo-Pacifique, 51 (30 %) sont classées dans une catégorie menacée (vulnérable ou en danger), et 23 autres (13 %) sont quasi menacées. En 1998, un épisode de blanchiment de grande ampleur a été observé dans les zones récifales du monde entier et les populations d'O. longirostris s'en sont trouvée fortement affectées.