Il est préférable de maintenir Peckoltia braueri dans un aquarium faiblement éclairé avec un bon nombre de cachettes, créées avec des plantes, du bois flottant, des rochers ou des grottes artificielles (frayères pleco). Pour maintenir plusieurs spécimens dans le même aquarium, ou avec d'autres poissons de fond, un aquarium de 100x40 cm est recommandé : ce poisson peut être très territorial et, en l'absence de cachettes appropriées, il peut être agressif envers les autres poissons de fond. Lorsqu'il est élevé seul, un aquarium de 80x35 cm est suffisant.
Une forte oxygénation est indispensable pour le maintenir correctement avec beaucoup de courants. Un système de filtration puissant est recommandé, car ce poisson produit beaucoup de déchets.
Dans la plupart des cas, Peckoltia braueri se montrera pacifique et pourra être conservé avec une grande variété de poissons. Pendant la journée, il reste généralement hors de vue dans l'une de ses cachettes, mais une fois le crépuscule venu, il devient actif et commence à se nourrir. Une fois acclimaté, il sort souvent et se montre plutôt actif , même en journée.
Les peckoltias peuvent être maintenus seuls ou en groupe. Si un petit groupe de ces poissons est maintenu ensemble, il est très important de s'assurer que tous les poissons ont assez d'espace pour établir leurs propres petits territoires, et que suffisamment de cachettes (plantes, rochers, bois) sont présentes. Sinon, ce poisson paisible peut devenir stressé et développer un caractère agressif envers son propre genre ainsi qu'envers les autres habitants du fond.