Atyaephyra desmaresti se nourrit de débris végétaux, de plantes aquatiques et des dépôts algaire.
Le régime alimentaire de cette espèce est essentiellement détritivore
Une étude des contenus digestifs révèle une préférence marquée pour les détri-tus (100 % Oc.) et les diatomées (71 %). Les chlo-rophytes (18,7 %), les cyanophytes (6,0 %) et les pro-tozoaires (5,4 %) sont effectivement moins souvent consommés.
On note parmi les algues, une consommation plus importante de diatomées (1,4 %) par rapport aux chlorophytes (0,14 %) et aux cyanophytes (0,016%). Les chlorophytes sont représentées seulement par des algues microscopiques non filamenteuses. Les cyanophytes ne représentent qu'un très faible apport dans le régime alimentaire d'Atyephyra.
Quand aux détritus, ils consistent principalement en du matériel très petit d'origine végétale en état avancé de décomposition. Ce sont également des restes d'algues vertes filamenteuses indéterminables et des fragments de valves de diatomées. Les détritus d'origine animale sont représentés par des spicules d'éponge, des restes de cuticule et des soies de microinvertébrés.
Les algues sont, cependant, absentes dans les estomacs de crevettes capturées en hiver, alors qu'au printemps, les diatomées font leur apparition. En été, parmi les algues, ce sont les chlorophytes et les diatomées qui sont les plus consommées.
En aquarium, elles se nourriront du bio-film recouvrant les pierres, racines, feuilles... mais aussi de végétaux ou d'animaux morts et autres "déchets".
On peut leur proposer toutes sortes de nourritures, spécialisées ou non, comme des aliments pour crevettes, aliments pour poissons de fond, légumes pochés... Dans des aquariums matures ou communautaires de grande taille, elles seront assez autonomes quant à leur alimentation. Elles ne nécessiteront alors pas de distribution de nourriture spécifique, tant que la compétition alimentaire n'est trop forte.