Brachygobius doriae est présent dans les cours d'eau de plaine et côtiers et les estuaires intérieurs, dans les eaux douces à saumâtres, y compris les mangroves et les forêts.
Essentiellement nocturnes, les Gobius passent la journée fixés à une roche ou à une vitre par la ventouse formée par la réunion de leurs nageoires ventrales. Ils préfèrent une eau légèrement saumâtre. Du corail broyé ou du sable corallien peut être mélangé au substrat pour servir de tampon si nécessaire, ou du sel marin ajouté à une dose d'environ deux grammes par litre (2 g/l)
Bien que les mâles en particulier soient territoriaux, Brachygobius doriae reste un poisson vivant en groupe qui peut être abondant et former des bancs lâches.
Un minimum de six individus devrait être l'achat minimum, car l'agression diminue avec l'augmentation du nombre de poissons. L'agressivité est mieux répartie entre les individus et les poissons sont plus audacieux et présentent un comportement plus naturel.
Prévoyez beaucoup de cachettes (grottes, tuyaux, racines...) et de couvertures végétales, l'idée étant de créer des lignes de vue brisées pour permettre aux individus les plus faibles d'échapper à l'attention continue des poissons dominants.
Le substrat devra être composé de boue, de sable et de limon avec des matières organiques sus-jacentes telles que des feuilles mortes, des racines de mangrove et du bois flotté submergé.
La filtration ne doit pas être forte et peut avantageusement être constituée de filtre éponge ou de filtre de Hambourg (HMF).
Note : Certaines populations habitent d'anciens habitats de marécages tourbeux avec une eau très colorée et de couleur thé, une très faible acidité, une conductivité minimale et une dureté négligeable.
On peut donc estimer que ce gobie peut supporter de nombreux et très différents milieux et paramètres de l'eau.
Attention ! Néanmoins, il sera nécessaire de se renseigner sur la provenance, sauvage ou d'élevage, et sur les conditions de maintenance, ou de biotope, précédent l'acclimatation dans votre bac.
On mesurera impérativement l'eau de transport des poissons pour adapter leur maintenance à leur milieu d'origine ou d'élevage. On questionnera le revendeur pour plus de précision. Si celui-ci est compétent, il ne manquera pas de savoir d'où proviennent ses poissons et leur origine.