Melanotaenia sexlineata fréquente les cours d'eau à écoulement lent, généralement petits, de la forêt pluviale. L'eau y est claire, mais souvent teintée de tanin avec des valeurs de pH allant de 6,1 à 6,5 et une température de 25°C Ses cours d'eau sont , et. (Munro 1964, GR Allen comm. pers. 2019).
Il n'y a peu de rapport sérieux de maintenance et d'élevage pour cette espèce et on ne pourra ici qu'énoncer des pistes d'accueil qui demanderont à être confirmées par l'expérience.
On tâchera de reproduire au mieux l'habitat naturel du poisson en lui proposant un aquarium "rivière", au courant modéré sur fond de graviers. L'eau sera moyennement dure et neutre à légèrement acide.
L'eau doit y être propre, bien oxygénée et plutôt stable en matière de température.
Bon nageur, le poisson arc-en-ciel de Fly River demandera un bon espace de nage et un bac "rivière" sera privilégié.
On ménagera une zone plantée en fond de bac pour rassurer les poissons et favoriser la reproduction.
La zone intermédiaire sera avantageusement parsemée de branchages et un tapis de feuilles permettra d'ambrer l'eau et de maintenir une relative acidité.
L'éclairage sera choisi en fonction des plantes cultivées, mais l'aquarium devra rester assez sombre grace à des plantes surplombantes par exemple. Il faut garder à l'esprit que le ruisseau coule sous le couvert forestier et que la lumière est tamisée par les frondaisons.
La filtration devra être efficace et le rejet devra pouvoir être modifié pour simuler les changements saisonniers et "oxygéner" l'eau, au besoin à l'aide d'un venturi supplémentaire.
Grégaire, Melanotaenia sexlineata devra être maintenu en groupe et réclamera donc un bac d'un minimum de deux-cent cinquante litres. Il est en effet fortement recommandé de le maintenir en groupe d'au moins six à douze individus afin qu'il se sente en confiance. L'agressivité, toute relative, des mâles vis à vis de leurs congénères et le harcèlement des femelles n'en sera que dilué et son comportement, et notamment les parades nuptiales, n'en sera que plus intéressant.
Attention ! : Tous les Melanotaenia, insectivores de surface, peuvent sauter, un couvercle est donc fortement recommandé.